Povijesni roman Šutnja (Chinmoku) danas se općenito smatra Endovim najznačajnijim djelom i "jednim od najboljih romana 20. stoljeća". Radnja romana smještena je u 17. stoljeće i prati mladoga portugalskog misionara Sebastiana Rodriguesa, koji odlazi u tajnu misiju u Japan, u kojem traju nesmiljeni vjerski progoni i mučenja kršćana.

Osim što mu je zadatak pomoći preostaloj kršćanskoj zajednici, Rodrigues želi istražiti i gotovo nevjerojatnu vijest da se njegov mentor, jedan od najgorljivijih i najpredanijih kršćanskih misionara, otac Ferreira, odrekao kršćanske vjere.

Kako širiti kršćanstvo u zemlji toliko drugačije tradicije, vjere i običaja te uz tako stroge protukršćanske zakone? Što ako je jedini način da pomogne progonjenim kršćanima odricanje od vlastite vjere? Put mladog misionara prožet je brojnim moralnim i filozofskim dilemama, patnjom i iskušenjima...