Katolička je crkva, nošena krilima protureformacije i velikih geografskih otkrića, dolazila u kontakt s nizom poganih naroda i nije čekala dugo da ih pokuša pokrstiti. Iako su sve crkvene snage sudjelovale u širenju kršćanstva, misionarski su žalac činili isusovci, koji su imali vojnički mentalitet i vrlo veliku mobilnost te su se bili spremni do krajnosti prilagoditi društvu koje ih okružuje. Jedan od ranih isusovačkih misijskih prvaka bio je sv. Franjo Ksaverski koji je djelovao na Dalekom istoku, gdje su Portugalci proširili svoju trgovačku i kolonijalnu mrežu. Ubrzo je dočuo za državu Japan, u koju dolazi uspostavljajući u njoj prvu kršćansku zajednicu. Njegovi su nasljednici nastavili njegovim koracima i uspjeli pokrstiti vrlo mnogo Japanaca svih društvenih slojeva, toliko da su u jednom trenutku gotovo uspjeli pokrstiti cijelo Carstvo. No, misionari su nakraju ipak doživjeli neuspjeh.